באיטום הפוך משולב סדר השכבות משתנה אך האפקטיביות נשמרת ואף משתפרת בפרויקטים מסוימים, במיוחד כאלה שבהם קיימות מגבלות תשתית או דרישות הגנה מיוחדות. השיטה מתחילה בהתזת BB1 – חומר מוקצף מבודד, קל משקל, אשר נצמד לגג הקיים ויוצר בסיס אחיד, מבודד ועמיד. לאחריו מתבצעת התזת שכבת פוליאורה חמה – חומר איטום מתועש, גמיש, נטול תפרים, עם עמידות גבוהה מאוד למים עומדים, קרינת UV ושחיקה. בשלב הסופי יוצקים שכבת בטון שיפועים מעל שכבת הפוליאורה, המשמשת הן כהגנה פיזית על שכבת האיטום והן כאמצעי להולכת מים לניקוזים באופן תקני. היתרון המרכזי בגישה זו הוא בכך ששכבת האיטום מוגנת פיזית תחת הבטון, מה שמאריך את חיי המערכת ומקטין את הסיכוי לנזקים ממכונות, חפצים או עבודות עתידיות. השיטה מותאמת במיוחד לפרויקטים של חידוש גגות, חניונים תת-קרקעיים, מרפסות, שטחים ציבוריים ועוד.